人們擔心《Matrix 4》會狗尾續貂，以Neo的自我犧牲拯救了整個世界，三部曲不就非常完滿嗎？
崔妮蒂，Trinity，名字便是聖三一的意思。事不過三，在形上理念裡面，三角形是最穩定的結構，而完美的三角形只得一個——柏拉圖將他的手指指向了天，在世的眾多三角不過是那個理型的投影。亞里士多德五指伸向的在世經驗，某程度只是形上的複製品、真理的抄本、代碼之源的轉譯而已。2000年前的人已意識到這個世界並非真實的，我們沒法觸摸到物自身，觸得到的只是物相，而相的背後才是真實。
那麼怎解釋世界正走向滅亡？
那一定是真實的源頭出了些問題，像電子遊戲的無形的bug產生了玩家們可見的Glitch，但玩家是無法修正的，只有接近源代碼的工程師們可以令到整個Matrix回復正常——Reboot即大重設。
然而，在世的人反對這種總工程師的重設，因為它的代價就是犧牲一整代人已經擁有的東西，並且罔顧了人們的自由意志和意願。於是，對抗在所難免，但對方已控制了整個Matrix，有八爪魚機械人和特工Smith，以及全人類作為它的活體電池，覺醒的反抗者們只能躲進最後的避難所——錫安。
在Matrix設計者的角度，這些可以自出自入的反抗者都是危害系統穩定的因子，就像電腦病毒，需要逐個消除。然而，經過六次大重設後，總工程師發現這樣是無補於事的，因為人類只要尚有自由意志，就總會有人覺醒，意識到整個世界並不對勁，發現Matrix的真相。
你可能馬上想到，只要在程式做手腳，抹出他們的自由意志不就成了嗎？
總工程師在第二次大重設時已經試過，並發現行不通。他把Matrix塑造成一個天堂，任何居住在裡面的人都可以隨心所慾得到幸福，不需要做抉擇，也沒有痛苦，但系統依然崩潰了，活池出現大規模死亡，這時Matrix才知道人類是不可以不行使自由意志的，否則他們會自毀。經過機器學習，Matrix首度引入選擇的力量，系統才大幅穩定下來。只要生活有得揀，人類對世界的質疑就會降低——大眾娛樂正正提供了無限選擇，虛以委蛇地滿足了人們行使自由的需要，但這種所謂的「人間世」始終難抹其虛擬，享樂仍會感到空虛——這股空虛，揭示生活的虛假本質。
續文：
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